Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REXO2Q9Y3B8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms