Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms