Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms