Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms