Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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