Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms