Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLIP2Q9UDT6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms