Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms