Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms