Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms