Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms