Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms