Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms