Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms