Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms