Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms