Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms