Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms