Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM29Q9BSF4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms