Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms