Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms