Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms