Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms