Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDRT15Q96T59 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms