Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms