Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms