Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAB3Q8WWW8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAB3Q8WWW8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms