Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms