Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms