Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms