Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF148Q8N7C7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF148Q8N7C7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RNF148Q8N7C7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RNF148Q8N7C7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RNF148Q8N7C7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RNF148Q8N7C7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RNF148Q8N7C7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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