Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACS2Q86VP3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 734.8 ms