Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SV2AQ7L0J3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms