Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms