Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms