Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms