Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms