Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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