Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms