Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms