Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms