Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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