Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms