Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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RTN1Q16799 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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