Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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