Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKN3Q16667 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms