Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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