Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALX1Q15699 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms