Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TLR1Q15399 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TLR1Q15399 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms