Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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